وی پیش از این بعنوان مدیرعامل شرکت سرمایه‌گذاری سپه به خدمت مشغول بود و قبل از آن مدیریت عامل صندوق تثبیت بازار سرمایه را بر عهده داشت.
آقابابائی دارای مدرک دکترای علوم اقتصادی از دانشگاه تهران و عضو هیأت علمی دانشگاه خوارزمی می‌باشد.
به گزارش روابط عمومی صندوق بازنشستگی کارکنان بانک‌ها، امروز در مراسمی با حضور دکتر مرادپور سرپرست معاونت بانک و بیمه وزارت امور اقتصادی و دارایی و همچنین هیئت مدیره و مدیران صندوق بازنشستگی کارکنان بانک‌ها، سیدمهدی سدیدی تودیع و محمد ابراهیم آقابابائی معارفه گردید.
